Kết quả giải trình tự gen cho thấy nam bệnh nhân sống tại chung cư Sunview Town mắc biến chủng siêu lây nhiễm Ấn Độ (B.1.617.2).
Ngày 18/5/2021, TPHCM ghi nhận 2 trường hợp lây nhiễm trong cộng đồng, trong đó có bệnh nhân (BN) 4514 cư ngụ tại Chung cư Sunview Town, TP Thủ Đức. Ngay lập tức các đơn vị liên quan đã bắt tay vào việc giải trình tự gen.
Theo báo cáo của nhóm nghiên cứu Covid-19, do Bệnh viện (BV) Bệnh Nhiệt Đới và Đơn vị Nghiên cứu Lâm Sàng Đại Học Oxford thực hiện, từ mẫu bệnh phẩm ngày 18/5 của BN 4514, đã thu nhận được 1 bộ gen SARS-CoV-2 từ một mẫu RNA đưa vào phân tích.
Kết quả giải trình tự gen cho thấy trường hợp mắc Covid-19 thuộc biến chủng siêu lây nhiễm Ấn Độ (ảnh: Phạm Nguyễn). Kết quả định danh bằng phần mềm Pangolin cho thấy, bộ gen thu được thuộc biến chủng B.1.617.2. Kết quả xác định đột biến bằng COV-GLUE cho thấy, bộ gen mang 6 đột biến thay đổi aminoacid tiêu biểu (T19R, L452R, T478K, D614G, P681R, D950N) và một đột biến đứt đoạn (156-158) trên vùng protein gai của biến chủng B.1.617.2. Nhóm nghiên cứu kết luận BN 4514 nhiễm SARS-CoV-2 biến chủng Ấn Độ B.1.617.2, cùng chủng đang lưu hành hiện nay tại các tỉnh phía Bắc Việt Nam.
Liên quan đến BN 4514 còn có trường hợp nhiễm đã được xác định là nữ đồng nghiệp của ca nhiễm cư ngụ tại quận 7. Họ cùng làm việc trong đội 8 người tại công ty Grove, đường Pasteur, ở quận 3.
Ngành Y tế TPHCM đã khẩn trương khoanh vùng, truy vết, lấy mẫu xét nghiệm trên diện rộng (ảnh: Phạm Nguyễn). Bệnh nhân cư ngụ tại Quận 7, theo lời khai, đã rời khỏi TPHCM từ ngày 24/4 đi Hải Phòng và trở về TPHCM ngày 5/5, trên chuyến bay đi VN1179. Bệnh nhân có dấu hiệu sốt, tự mua thuốc uống vào ngày 8/5.
Căn cứ kết quả dấu hiệu lâm sàng, yếu tố dịch tễ và xét nghiệm thì có nhiều chứng cứ cho thấy BN 4514 bị lây từ bệnh nhân cư ngụ tại Quận 7. Tuy nhiên, đối với trường hợp bệnh nhân ở quận 7, do tình trạng bệnh đang trong quá trình hồi phục nên rất khó để thực hiện giải trình tự gen. Nhóm nghiên cứu đang cố gắng để có thể giải trình tự bộ gen của SARS-CoV-2 trên bệnh nhân này, từ đó đưa ra kết luận chính xác nhất về nguồn lây Covid-19 tại TPHCM.
Vân Sơn
